為大力發展南陽市中醫藥事業，2012年1月20日南陽市編制委員會下發文件《關于南陽市中醫藥管理局機構設置有關問題的通知》(宛編[2012]19號)，通知明確：“市中醫管理局更名為市中醫藥管理局，正處級單位，同時加掛南陽市中醫藥事業發展工作委員會辦公室牌子;市中醫藥管理局內設4個科室，行政編制12名，工勤編制1名，業務工作獨立，財務單列?！?通知還明確了市中醫藥管理局的職能，把由市科技局領導的市中藥材開發辦公室劃歸市中醫藥管理局領導等事項。

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